引起脊柱侧弯的病因至今不明确。医学上大致将脊柱侧弯划分为先天性和特发性，据调查发现，特发性脊柱侧弯约占95.77%，先天性约占3.8%。
先天性的是指脊柱骨性结构发生异常，即出生后即有三角形半椎体、蝶形椎、融合椎、与胸椎相连的肋骨并肋融合等异常结构，导致脊柱发生倾斜，导致侧弯或后凸畸形，先天性脊柱侧弯还往往伴有脊髓的畸形，如硬脊膜膨出（在下腰部可触及鸡蛋大甚至拳头大的软包块，还有波动感）、脊髓纵裂或脊髓空洞，由于脊柱畸形合并脊髓神经异常，因此先天性脊柱侧弯矫形时危险性常常大于特发性脊柱侧弯。
下图表示的就是先天性的半椎体和椎体分节不良。
而特发性脊柱侧弯，发生的原因目前还不明确。特发性脊柱侧凸的脊柱骨性结构基本没有异常。
还有一少部分患者，由于神经肌肉力量的失平衡，导致脊柱原来应有生理弯曲变成了病理弯曲，即原有的胸椎后凸变成了侧凸等。
另外还有一些特殊疾病也可引起脊柱侧弯，如：小儿麻痹、脑瘫、脊髓空洞症、神经纤维瘤病、马凡氏综合症以及外伤或某些炎症性病变等。
脊柱侧弯在青少年发病率最高，一般在1.0%-1.5%，女性高于男性，比例为4：1。具体的原因还不清楚。
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